距離第三季結尾已經過去一年時間了，Christine Johnson在第三季結尾的悲劇中喪生，異常點研究中心的三名核心隊員（Danny、Connor和Abby）仍然下落不明，英國內政部對Lester的領導能力產生了懷疑－－他們認為Lester根本無力獨自指揮這樣一個危險而耗資巨大的項目。內政部決定為異常點研究中心注入新鮮血液：Philip Burton。Philip既是一個著名的科學家，也是一個富可敵國的商人。異常點研究中心變更為「公私合營」后，總部也搬到了Philip的工業大廈里－－這里每天都有很多科學家進進出出，與原來異常點研究中心的「軍管」氛圍完全不同。也正是因為如此，「誰是異常點研究中心的實際控制者？」成了一個無解的問題－－盡管Lester繼續負責研究中心的日常事務，但財政大權和部分行動的決定權卻在Philip手中。
為了填補Connor、Abby和Danny失蹤后留下的空白，異常點研究中心聘請Matt擔任新的外勤隊長，負責處理怪獸入侵事件。Matt當過兵，也當過動物學家，對動物有著超乎常人的親和力。Matt寡言少語，很少談論自己的過去，他加入異常點研究中心的真實目的始終是個謎。Connor以前擔任的「科技總監」的職責由新人Jess接管，這位對技術十分癡迷的女孩現在控制著異常點研究中心的一切技術活。與此同時，Jess悄悄愛上了Becker上尉，但粗心的Becker渾然不知。自從異常點研究中心被毀后，Becker便離開了軍隊。他認為自己該為Connor等人的失蹤負責。他現在以平民的身份擔任新異常點研究中心的警衛隊長，配備了新的制服和新的泰瑟槍。
與此同時，被困在白堊紀的Connor和Abby依靠樹根和蟲子為食，艱難地熬過了一年時光。在這一年里，他們學到了很多對付遠古怪獸的方法，聽覺、感覺、觸覺、嗅覺和動作都敏銳了許多。正所謂患難見真情，Abby和Connor更加親密了……但現在似乎不是談情說愛的好時機。務實的Abby比愛幻想的Connor更能適應他們現在的處境，更何況Connor是個科技迷，離開那些高科技設備讓他感覺很難受。他們最終回到了正確的時間線，但……異常點研究中心的變化實在是太大了！
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